Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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