Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms