Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms