Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms