Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTF1AQ7RTS3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms