Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP34Q70CQ2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP34Q70CQ2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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