Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms