Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms