Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KHDC3LQ587J8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms