Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms