Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC184Q52MB2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms