Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP21-3Q3LHN1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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