Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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