Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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