Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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