Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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