Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEBPEQ15744 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms