Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms