Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOMM20Q15388 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOMM20Q15388 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms