Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
R3HDM1Q15032 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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