Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms