Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms