Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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