Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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