Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE7AQ13946 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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