Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms