Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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