Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms