Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms