Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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