Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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