Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF5Q13243 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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