Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms