Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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