Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms