Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms