Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms