Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms