Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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