Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms