Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms