Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSF1Q00613 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms