Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3F3AP84243 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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