Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRX1P78414 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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