Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2NP61088 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2NP61088 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2NP61088 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBE2NP61088 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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UBE2NP61088 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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UBE2NP61088 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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