Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms