Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM3BP58499 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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