Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AQP4P55087 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AQP4P55087 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AQP4P55087 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AQP4P55087 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AQP4P55087 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AQP4P55087 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AQP4P55087 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms