Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA4P54764 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms