Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLK1P49759 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLK1P49759 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms